El cabildo le honró con suntuoso funeral sepultura entre el coro y capilla mayor aquella santa iglesia, poniendo en la losa la siguiente inscripción:
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''Aquí, yace D. Pedro Duque Cornejo, estatuario de cámara de la reyna nuestra señora : varon de singular bondad y sencillez; célebre profesor de la arquitectura; Pintura y escultura. Hizo la sillería del coro de esta santa iglesia, que concluyó con su vida año de 1757 a los ochenta de su edad.''
''Requiescat in pace.''
</blockquote>